蛋白质-蛋白质相互作用组（Protein-Protein Interaction Network, PPI网络）是指在细胞内外，蛋白质之间通过相互作用形成的复杂网络。蛋白质是生命活动的基本执行者，它们通过相互作用形成多个生物学过程的核心。具体来说，这些相互作用可以影响信号传导、代谢途径、细胞周期调控、基因表达以及免疫应答等多种生命过程。蛋白质-蛋白质相互作用组的研究不仅能够帮助我们理解生命的基本机制，还对疾病的诊断和治疗具有意义。许多疾病，如癌症、神经退行性疾病以及心血管疾病等，均与蛋白质相互作用网络的异常有关。因此，深入研究蛋白质-蛋白质相互作用组，不仅有助于揭示疾病的发病机制，还可能为新型治疗方法的开发提供线索。在实际应用中，蛋白质-蛋白质相互作用组的研究可以帮助科学家们识别潜在的药物靶点。通过分析这些网络，研究者可以发现哪些蛋白质在疾病状态下发生了异常相互作用，从而确定可能的干预点。此外，蛋白质-蛋白质相互作用组的研究还可以用于生物标志物的发现，这对于早期诊断和个性化治疗具有意义。在生物技术和制药工业中，理解和操控蛋白质-蛋白质相互作用组也可以促进新药的研发和现有药物的优化。

一、研究蛋白质-蛋白质相互作用组的方法与技术

1、实验方法

研究蛋白质-蛋白质相互作用组的实验方法多种多样，其中最常用的包括酵母双杂交系统、共免疫沉淀、荧光共振能量转移（FRET）和生物层干涉技术（BLI）等。酵母双杂交系统通过在酵母细胞中重建蛋白质相互作用来识别新的相互作用对，而共免疫沉淀则在体外条件下检测蛋白质复合物。FRET是一种利用荧光信号传递的技术，可以在活细胞中实时监测蛋白质相互作用。BLI则通过检测光干涉信号的变化，提供快速和定量的相互作用分析。

2、计算方法

随着计算技术的进步，计算机辅助方法在蛋白质-蛋白质相互作用组研究中的应用也越来越广泛。分子对接、分子动力学模拟和机器学习算法都被用于预测和分析蛋白质相互作用。分子对接通过模拟蛋白质的三维结构来预测相互作用位点，而分子动力学模拟则提供了关于相互作用动态变化的信息。机器学习算法利用大量的实验数据进行训练，可以自动识别和预测新的相互作用模式。

二、实验注意事项

在进行蛋白质-蛋白质相互作用组研究时，研究者应遵循系统的技术流程，包括样品准备、实验设计、数据采集和分析。样品准备是整个流程的基础，需确保样品的纯度和稳定性。实验设计需要考虑多种因素，如实验条件的选择和对照组的设置，以提高数据的可靠性。数据采集和分析则需要结合实验和计算方法，确保结果的准确性和重复性。在研究过程中，研究者还应注意避免实验中的假阳性和假阴性结果，这需要通过合理的实验设计和严谨的数据分析来实现。

百泰派克生物科技拥有先进的实验平台和专业的生物信息学团队，能够为客户提供从实验设计到数据分析的一站式解决方案。无论是基础研究还是临床应用，我们都能根据客户需求，提供定制化的分析服务。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

>>点击了解更多优质服务项目