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联川生物—microRNA发现与验证一站式解决方案

作者:联川生物技术公司 2009-05-06T00:00 (访问量:3164)

近年来microRNA(miRNA)的研究发展十分迅速,科研人员不断发现新的miRNA,并揭示出这些微小调节因子在许多生物学功能方面起到非常重要的调控作用。miRBase序列数据库[1]是存储新发现miRNA信息最主要的公共数据库之一,而它收录的miRNA序列信息数量从2002年的仅218条迅速增至最新版本(13.0版)的将近10,000条,意味着还存在更多的miRNA有待被发现。

多项先进技术的发展直接促进了miRNA新发现的增长速率,如高通量测序和定制微流体阵列。随着这些新技术被更广泛地应用,使发现陌生生物体内的新miRNA序列成为可能。一种集miRNA发现、确认和验证的实验过程正在被普及。

深度测序-发现 ---> 微阵列-确认 ---> Real-time PCR-验证

在一项最新的研究中,中国科学院上海分院的研究人员应用上述步骤验证了家蚕体内的许多新miRNA[2]。

深度测序实验(Illumina GA 边测序边合成平台)得到了共95,184条与家蚕基因组符合的非冗余tag,而pipiline分析技术识别出其中3,750为可能的miRNA前体。在定制微阵列(LC Sciences µParaflo®微流体平台)上合成的候选miRNA探针确认了候选miRNA中的354条。进一步的microarray实验分析了这些miRNA在家蚕处于不同发育阶段(卵,幼虫,蛹,成熟体)的差异表达水平。最后,用Real-time PCR(GenePharma,分子信标平台)验证了其中几条显著差异表达的miRNA,认为它们可能对于胚胎形成(embryogenesis)和蜕变过程(metamorphosis)具有重要的生物学作用。

我们都知道miRNA在调节细胞功能活动中扮演着重要角色。因此,确认例如家蚕等传统工业或农业重要物种的miRNA,可以更好的理解它们的发育,成熟,疾病与抗病机理。

LC Sciences提供了一整套的miRNA分析服务,让所有研究人员都可以利用最新的技术得到令人兴奋的生物学发现。这些全方位的服务是一站式的,能够快速得到所需的实验结果,从而加快生物学和生物医学的研究进程。目前,我们的服务包括:用于发现和数字化表达谱分析应用的miRNA测序服务,用于差异表达谱分析和确认新发现miRNA的miRNA微阵列检测服务,以及用于miRNA表达水平定量分析和微阵列结果验证的Real-time PCR服务。

更多关于LC Sciences miRNA发现和分析服务的信息,请查看: http://www.lc-bio.com/

关于LC Sciences与联川生物

LC Sciences(美国)是一家专业提供基因组及蛋白质组产品与服务的生物技术公司,提供全方位的DNA,RNA及多肽微阵列服务,可用于核酸/蛋白表达谱与功能分析,生物标记发现和新药筛选,研发应用于诊断和生物传感的微型实验设备。基于**的µParaflo®微流体技术,LC Sciences可提供具有高度灵活性和定制化的创新产品来满足客户快速变化的需求。联川生物作为LC Sciences在中国成立的全资子公司,随时为您提供最新的生物技术服务和前沿信息。欢迎拨打免费咨询热线:800-857-1452。

1.miRBase序列数据库是一个提供包括miRNA序列数据、注释、预测基因靶标等信息的全方位数据库,是存储miRNA信息最主要的公共数据库之一。miRBase同时提供提供基因命名服务,为新发现的miRNA在发布之前分配正式的miRNA命名。以上信息均为免费服务,详情请登陆http://microrna.sanger.ac.uk/.

2.Zhang Y, Zhou X, Ge X, Jiang J, Li M, Jia S, Yang X, Kan Y, Miao X, Zhao G, Li F, Huang Y. (2009) Insect-Specific microRNA Involved in the Development of the Silkworm Bombyx mori. PLoS ONE 4(3), e4677.

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